זאת המגפה הראשונה בהיסטוריה, בה קיימת יכולת לבצע ניתוח גנטי של הנגיף בזמן אמת ולגלות מי נדבק ממי. יש כמה ממצאים מעניינים.
1) ב-1.19 נלקחה דגימה מאדם שטס מווהאן לסיאטל. בבדיקת הדגימה הוא אובחן כחולה הראשון בארה"ב. הוא הוכנס לבידוד בבית חולים. אנשים שהיו אתו בקשר נבדקו. עד כאן הכל טוב.
ב-29.2 נלקחה דגימה מתלמיד תיכון באותו איזור של סיאטל, בו אובחן החולה הראשון. התוצאה חזרה חיובית. ניתוח גנטי הראה סיכוי גבוה מאוד לכך שהתלמיד נדבק משרשת הדבקה, שהתחילה מהחולה הראשון שאובחן. זה אומר שמישהו נדבק מחולה ידוע עוד בינואר ולא התגלה. הנגיף הסתובב בסיאטל במשך יותר מחודש עד שהתגלה שוב במקרה.
2) בין 19 ל-23 בינואר אישה סינית ביקרה במינכן, גרמניה, והשתתפה במספר פגישות עבודה. כשחזרה לסין, אובחנה כחולה בנגיף. היא הודיעה על כך לאנשים שנפגשה אתם בגרמניה. הם וכל סביבתם נבדקו ונמצאו לא מעט מקרים. כולם בודדו ונראה היה שהכל עבר בשלום. לאחר חודש התחילו להתגלות מקרים בצפון איטליה. באופן מפתיע מאוד בדיקה גנטית של רובם המוחלט(אבל לא כולם) של המקרים האיטלקים הראתה כי קיים סיכוי גבוה שהם נדבקו משרשרת הדבקה, שהתחילה מאותה הסינית, או מישהו קרוב אליה מאוד בשרשרת ההדבקה ובזמן. לא מדובר בוודאות של 100%, אבל זה בהחלט נראה כתרחיש הסביר ביותר. אם זה אכן מה שקרה, יש לכך השלכות משמעותיות:
א) עם כל ההקפדה של הגרמנים, הם פספסו נדבק, שהגיע לצפון איטליה וגרם להתפרצות שם.
ב) בואו נראה מה זה אומר על קצב ההתפשטות. כמה נדבקים יש באיטליה? בישראל הורו ל-10,000 ישראלים, שחזרו מאיטליה להיכנס לבידוד. עד כמה שיכלתי למצוא, לפחות 9 מהחולים שהתגלו בישראל חזרו מאיטליה. נניח ש-50% התגלו - נראה לי סביר. זה אומר שיש 18 נדבקים מתוך 10,000, שזה 0.18%. אם נניח שמספר הנדבקים בקרב אוכלוסיית איטליה דומה לזה שבקרב התיירים, יוצא שיש באיטליה 109,000 נדבקים. יש פה הרבה הנחות, אבל נראה לי שזה נותן את סדר הגודל. עכשיו תחשבו מה זה אומר שתוך חודש חולה אחד הפך ל-109,000, וזה עוד בלי לספור את הנדבקים מאותה השרשרת מחוץ לאיטליה. ארצות רבות מאוד גילו את הנגיף אצל אנשים שבאו מאיטליה. זה לא רק ישראל. זה קורה בכל מקום במספרים מאוד גבוהים. אפשר לנסות לחפש נתונים ממקומות אחרים. עכשיו תשאלו למה יש רק 107 מתים באיטליה? אם המחלה מתפשטת כל כך מהר ולוקח זמן עד שמתים, אז מספר המתים היום מלמד על מספר החולים לפני זמן מה והרבה הרבה יותר צפויים למות בשבועות הקרובים. אם למישהו יש מידע נוסף או שונה, אשמח לראות. המספרים לגבי איטליה פשוט מטורפים ובאמת קשה להבין איך זה קרה.
https://nextstrain.org/ncov
