עמלת היוון עובדת באופן הבא:
בכל חודש בנק ישראל מפרסם מה הייתה הריבית הממוצעת בחודש החולף, לריבית צמודה וריבית לא צמודה לפי חלוקה לקבוצות של 5 שנים (1-5, 5-10, 10-15) וכו׳.
כאשר אתה רוצה לפרוע מסלול מסוים צריך להסתכל על הריבית הממוצעת שהייתה בחודש לקיחת ההלוואה לתקופה לה לקחת אותה (או הריבית בפועל שקיבלת באותו מסלול - הנמוך מביניהם), למול הריבית הממוצעת הנוכחית לתקופת הזמן שנותרה להלוואה (או במקרה של ריבית משתנה - עד למועד השינוי). אם הריבית המקורית הייתה גבוהה יותר מהריבית כיום, זה כאילו הבנק מפסיד כסף מכך שאתה פורע את ההלוואה, כי הוא ילווה את הכסף למישהו אחר בריבית נמוכה יותר - במקרה כזה יש לך עמלת היוון של ההפרש בין הריביות, כפול יתרת התקופה (או עד מועד שינוי הריבית, בהלוואה בריבית משתנה), כפול הסכום לפירעון.
אם לעומת זאת הריבית המקורית נמוכה יותר מהריבית כיום - אין עמלת היוון.
בנוסף יש עמלת אי הודעה מוקדמת, של אלפית מסכום הפירעון - אפשר להימנע ממנה אם תודיע לבנק לפחות 10 ימים לפני הפירעון המוקדם.
בנוסף יש עמלה תפעולית של 60 ש"ח.
ואחרונה - אם זו הלוואה צמודת מדד ופרעת בין הראשון ל15 לחודש (לפני פרסום המדד הקודם), תשלם עמלה של מחצית המדד שהייתה בחודש לפני).
בגדול ,במסלול צמוד מדד אפשר לפרוע משכנתא בלי קנס
לא נכון, גם בצמוד מדד יכולה להיות עמלת היוון.